绿色食品标志管理是按照《绿色食品标志管理办法》和证明商标使用管理规则对绿色食品产品质量和绿色食品生产经营企业使用绿色食品标志的有效监管。主要包括质量管理、标志商标管理和收费管理。其核心是产品质量管理，即通过有效的监管使企业产品质量及其管理体系维持超过认证时的水平。采取的主要手段是企业年度检查，年检的主体是绿色食品标志监督管理员，对象是绿色食品企业和产品，年检方式是通过对企业的实地检查、产品质量抽检，并进行综合考核评定，合格者继续许可使用绿色食品标志，不合格者限期整改或取消绿色食品标志使用权。

    标志商标管理是围绕绿色食品标志商标的注册、许可、使用和维权而进行的一系列管理。绿色食品标志是经国家工商行政管理机关注册的证明商标，用以证明该食品具有无污染的安全优质、营养的品质特性。它包括绿色食品标志图形、中文“绿色食品”、英文“Green Food”及中英文与图形组合共四种形式。核准注册商品为《商品注册用商品和服务国际分类》第1、2、3、5、29、30、31、32、33等九大类。绿色食品标志商标的四种形式的任何一种，未经中国绿色食品发展中心许可，不得擅自制造、伪造、销售或使用，否则将依法惩处。

    收费管理主要依据的是《绿色食品标志使用许可合同》、国家发展与改革委员会颁布的《绿色食品认证及标志使用收费管理办法》（发改价格[2003]2268号）和中心根据《办法》制定的《绿色食品认证及标志使用收费管理办法实施意见》。申请使用绿色食品标志使用，企业应支付的费用包括环境监测、产品检验费、认证费和标志使用费。

    环境监测费与产品检验费：主要用于申请过程中对产地环境的监测和产品质量的检验，具体由执行监测检验任务的监测中心，按有关标准收取。

    标志认证费：主要用于受理认证申请、认证检查、认证审核、制发证书、颁布公告等。

    标志使用费：主要用于标志管理和发展绿色食品事业。

    认证费和使用费在企业通过认证审核，与中国绿色食品发展中心签订《绿色食品标志使用许可合同》后，由中心收取。

    标志管理的主要手段和措施

    一、建立一支高素质专业化、专职化的标志监管队伍，即绿色食品标志监督管理员队伍。绿色食品标志管理工作涉及的面广、专业性强，必须有一支在数量上和质量上与事业发展相适应的经常化、专业化的监管队伍。队伍建设是保证各项监管工作顺利开展的基础。

    二、以企业年检为总抓手和切入点，全面开展质量管理、标志商标管理和收费管理。企业年检的主要内容有：企业实地检查、产品质量抽检和履行合同情况核查。对年检合格的产品，在证书加盖年检合格章，对年检不合格的产品，取消绿色食品标志使用权或限期整改。   

   三、积极主动配合工商和技术监督部门，清理、整顿和规范绿色食品市场。打击假冒绿色食品，规范超期用标和超范围用标行为。保障真正绿色食品生产经营者和消费者的合法权益。

    四、公开信息发布、自觉接受新闻媒体和消费者的监督。